文章题目：Integrative Spatial Analysis Reveals a Multi-layered Organization of Glioblastoma
发表时间：2024年第05期
期刊名称：Cell
影响因子：4.55
实验平台：10x单细胞测序；10x Visium空间转录组技术；Akoya CODEX空间蛋白技术
本研究利用单细胞测序技术分析了胶质瘤的细胞类型组成。采用10x单细胞测序技术，对28个胶质瘤样本进行了分析，确定了胶质瘤中各类细胞的组成。在先前的研究中，已经对IDH野生型GBM的癌细胞及免疫细胞主要状态进行了定义，涉及神经祖细胞样(NPC)、少突胶质细胞祖细胞样(OPC)、星形胶质细胞样(AC)及间充质样细胞(MES)，并识别了胶质瘤亚型中的关键免疫细胞。
利用空间转录组学和空间蛋白质组学相结合的方法，研究者分析了胶质瘤微环境中已定义细胞成分的空间分布。具体来说，采用10x Visium技术对19个胶质瘤样本（GBM与IDH突变）的空间转录组进行研究，同时对12个GBM样本使用Akoya CODEX进行空间蛋白质组分析，并结合已发表的13个高级别胶质母细胞瘤（GBM）数据集进行了综合评估。
在整合空间转录组与空间蛋白数据后，研究发现胶质瘤的微环境由若干小的局部区域组成，每个区域通常富含一种主要细胞状态。此外，胶质瘤细胞分布存在有序与无序两种结构形式，这种分布形态与肿瘤内缺氧水平的变化密切相关。分析显示，有序的分布区域内，特定的“状态配对”在多尺度上倾向于接近，形成了一个与缺氧相关的五层空间结构，包括缺氧/坏死生态位、缺氧邻近层、血管生成免疫中枢层、神经发育/GBM层与正常脑细胞层。
远离缺氧/坏死区域的肿瘤部分，其空间结构表现出无序状态，例如早期IDH突变的胶质瘤并未呈现出明显的缺氧特征，细胞的空间分布更加散乱。综上所述，本研究为理解胶质瘤细胞的空间分布形式提供了新的视角，并强调缺氧在这一结构中的核心驱动作用。
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